Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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