Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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