Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NAB1Q13506 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms