Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms