Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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