Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms