Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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