Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2BQ13224 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms