Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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