Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.61
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