Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms