Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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