Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
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