Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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