Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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