Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD3Q0VAK6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms