Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms