Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms