Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms