Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms