Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms