Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms