Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms