Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms