Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms