Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms