Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms