Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIM1P81133 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIM1P81133 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIM1P81133 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIM1P81133 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIM1P81133 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms