Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2BP78356 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2BP78356 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2BP78356 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2BP78356 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2BP78356 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms