Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms