Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC1P59894 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms