Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN15P56746 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms