Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFDNP55196 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFDNP55196 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AFDNP55196 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms