Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLTPP55058 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLTPP55058 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms