Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms