Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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PGGT1BP53609 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PGGT1BP53609 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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