Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms