Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP9P49458 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP9P49458 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP9P49458 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP9P49458 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms