Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RECQLP46063 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RECQLP46063 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RECQLP46063 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RECQLP46063 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RECQLP46063 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RECQLP46063 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RECQLP46063 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms