Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT2P45379 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT2P45379 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms