Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA4P43694 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA4P43694 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms