Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD52P43351 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD52P43351 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD52P43351 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms