Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP2P42575 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms