Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTGDSP41222 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms