Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP7BP35670 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7BP35670 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms