Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms