Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms