Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms