Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms