Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMLP26374 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMLP26374 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMLP26374 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMLP26374 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms